Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q08AU9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Q08AU9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q08AU9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q08AU9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q08AU9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q08AU9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q08AU9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q08AU9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q08AU9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms