Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms