Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms