Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou6f1Q07916 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou6f1Q07916 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms