Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
MestQ07646 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
MestQ07646 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
MestQ07646 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
MestQ07646 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
MestQ07646 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MestQ07646 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MestQ07646 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms