Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms