Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col17a1Q07563 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms