Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms