Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prrx2Q06348 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prrx2Q06348 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prrx2Q06348 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Prrx2Q06348 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Prrx2Q06348 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrx2Q06348 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
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Prrx2Q06348 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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