Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms