Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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