Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms