Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms