Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms