Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smarcad1Q04692 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms