Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr5Q04683 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms