Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnb1Q03717 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms