Protein–RNA interactions for Protein: Q03288

Asip, Agouti-signaling protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AsipQ03288 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AsipQ03288 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AsipQ03288 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AsipQ03288 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AsipQ03288 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AsipQ03288 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AsipQ03288 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AsipQ03288 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AsipQ03288 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AsipQ03288 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AsipQ03288 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AsipQ03288 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AsipQ03288 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AsipQ03288 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AsipQ03288 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AsipQ03288 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AsipQ03288 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AsipQ03288 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AsipQ03288 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms