Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms