Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms