Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb4Q02738 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb4Q02738 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms