Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms