Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2aQ01320 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms