Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja5Q01231 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms