Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoa1Q00623 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms