Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Scn1bP97952 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Scn1bP97952 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn1bP97952 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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