Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brca2P97929 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Brca2P97929 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brca2P97929 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms