Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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