Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms