Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
rp9P97762 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
rp9P97762 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
rp9P97762 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
rp9P97762 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
rp9P97762 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
rp9P97762 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
rp9P97762 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
rp9P97762 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
rp9P97762 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
rp9P97762 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
rp9P97762 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
rp9P97762 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
rp9P97762 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
rp9P97762 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
rp9P97762 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
rp9P97762 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
rp9P97762 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
rp9P97762 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms