Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2cP97760 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2cP97760 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms