Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkdcP97313 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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