Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcdP82347 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SgcdP82347 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SgcdP82347 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SgcdP82347 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SgcdP82347 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SgcdP82347 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SgcdP82347 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcdP82347 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcdP82347 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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