Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms