Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms