Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx1P80205 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms