Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms