Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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