Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms