Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad1P70340 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms