Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux2P70298 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux2P70298 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux2P70298 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux2P70298 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cux2P70298 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux2P70298 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cux2P70298 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms