Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NfixP70257 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfixP70257 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfixP70257 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfixP70257 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfixP70257 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfixP70257 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfixP70257 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfixP70257 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NfixP70257 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfixP70257 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfixP70257 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfixP70257 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfixP70257 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfixP70257 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfixP70257 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfixP70257 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfixP70257 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfixP70257 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfixP70257 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms