Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf6P70196 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf6P70196 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms