Protein–RNA interactions for Protein: P70158

Smpdl3a, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3aP70158 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpdl3aP70158 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpdl3aP70158 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpdl3aP70158 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpdl3aP70158 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms