Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbdsP70122 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SbdsP70122 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbdsP70122 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms