Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx1P63006 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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