Protein–RNA interactions for Protein: P62932

Fbxo40, F-box only protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo40P62932 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo40P62932 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms