Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms