Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp46P62069 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp46P62069 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp46P62069 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp46P62069 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp46P62069 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms