Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s1P61967 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms